其次是過敏反應(yīng)問題。對于一種食物過敏的人有時還會對一種以前他們不過敏的食物產(chǎn)生過敏，比如：科學(xué)家將玉米的某一段基因加入到核桃、小麥和貝類動物的基因中，蛋白質(zhì)也隨基因加了進(jìn)去，那么，以前吃玉米過敏的人就可能對這些核桃、小麥和貝類食品過敏。
此外，科學(xué)家們認(rèn)為外來基因會以一種人們當(dāng)前還不甚了解的方式破壞食物中的營養(yǎng)成分。而當(dāng)科學(xué)家把一個外來基因加入到植物或細(xì)菌中去，這個基因會與別的基因連接在一起。人們在食用了這種改良食物后，食物會在人體內(nèi)將抗藥性基因傳給致病的細(xì)菌，使人體產(chǎn)生抗藥性。
在美國，目前有20個左右的州掀起在食品包裝上“標(biāo)注轉(zhuǎn)基因”運(yùn)動。由于20多年來轉(zhuǎn)基因作物都是由種子公司在推動，因此有關(guān)這些公司“轉(zhuǎn)基因陰謀”的觀點(diǎn)得到認(rèn)同。孟山都便因?yàn)檗D(zhuǎn)基因種子一直遭受詬病。
但值得注意的是，雖然目前在全球范圍內(nèi)，對轉(zhuǎn)基因玉米、大豆、棉花等作物的質(zhì)疑和反對聲不絕于耳，實(shí)際上，作為世界農(nóng)業(yè)增產(chǎn)的重要手段，“轉(zhuǎn)基因化”已成世界農(nóng)業(yè)發(fā)展的大勢所趨。即使原先對轉(zhuǎn)基因作物持強(qiáng)烈反對態(tài)度的歐盟，也早已批準(zhǔn)種植多種轉(zhuǎn)基因作物。
“因?yàn)槭芰艘恍┬麄鞯挠绊?，民眾可能會產(chǎn)生迷惑。實(shí)際上美國從1996年到現(xiàn)在已經(jīng)推廣了17年，全世界75%的國家都生產(chǎn)、進(jìn)口了轉(zhuǎn)基因作物。”中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授、中國工程院院士戴景瑞指出，到目前為止沒有任何一個人，沒有任何一個環(huán)境受到轉(zhuǎn)基因食品的危害，少數(shù)人把轉(zhuǎn)基因妖魔化，是不負(fù)責(zé)任的。
安全性尚無定論
很長時間以來，有很多人在問：“轉(zhuǎn)基因作物對人體真的安全嗎？”然而，一直以來深陷“有毒”漩渦的轉(zhuǎn)基因作物，卻無法回答。因?yàn)樗媾R著一個尷尬現(xiàn)實(shí)：安全性始終沒有最終定論。這也使得圍繞轉(zhuǎn)基因的爭論，一直在繼續(xù)。
“沒有一個人因?yàn)槭秤棉D(zhuǎn)基因食品而生病，更沒有人致死。”美國植物細(xì)胞生物學(xué)家布魯姆瓦爾德表示，人們對轉(zhuǎn)基因作物安全性的擔(dān)心主要出于不了解，認(rèn)為轉(zhuǎn)基因?qū)儆诜亲匀坏挠N方式，存在安全隱患。實(shí)際上，動植物在自然狀態(tài)下也會出現(xiàn)基因突變，轉(zhuǎn)基因不過是運(yùn)用人類之手，有選擇地引導(dǎo)基因變化而已，這只是人類漫長育種史的一個發(fā)展階段，今后還會有更先進(jìn)的育種方式產(chǎn)生。
事實(shí)上，國際上一些重要的食品安全相關(guān)的組織都認(rèn)可了轉(zhuǎn)基因的安全性，譬如說聯(lián)合國糧農(nóng)組織、世界衛(wèi)生組織、歐盟委員會、美國科學(xué)院、美國食品藥品管理局（FDA）都確認(rèn)轉(zhuǎn)基因食品的安全性。在轉(zhuǎn)基因領(lǐng)域科學(xué)家看來，轉(zhuǎn)基因糧食在增產(chǎn)和抗蟲害等方面就有著極大的貢獻(xiàn)。
聯(lián)合國糧農(nóng)組織2011年公布數(shù)據(jù)顯示，世界市場上82％的棉花和75％的大豆都已經(jīng)轉(zhuǎn)基因化。據(jù)總部設(shè)在美國的國際農(nóng)業(yè)生物技術(shù)應(yīng)用服務(wù)組織介紹，自上世紀(jì)90年代中期起轉(zhuǎn)基因作物在全球范圍推廣種植，2011年全球轉(zhuǎn)基因作物種植面積達(dá)到1.6億公頃，包括德國、西班牙等歐盟國家在內(nèi)的29個國家已批準(zhǔn)24種轉(zhuǎn)基因作物的商業(yè)化種植。世界衛(wèi)生組織2005年發(fā)布報告說，國際市場上交易的轉(zhuǎn)基因作物均經(jīng)過嚴(yán)格審核，在大量實(shí)踐中并未發(fā)現(xiàn)危害人類生命健康的事例。
據(jù)了解，全球至今沒有完全公開轉(zhuǎn)基因物種的詳細(xì)報告，所以大眾對于轉(zhuǎn)基因食品或者作物都會存在疑慮的心理。食品安全專家董金獅表示，目前中國視同轉(zhuǎn)基因食品是無害的，“因?yàn)樵诂F(xiàn)有的試驗(yàn)科學(xué)條件下，沒有結(jié)論證明轉(zhuǎn)基因食品對人體一定有危害，但也不能證明一定無害，所以視同無害。”
在中央民族大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院首席科學(xué)家薛達(dá)元看來，“轉(zhuǎn)基因是否有害，說不清楚”。因?yàn)橐恍C(jī)構(gòu)做的一些實(shí)驗(yàn)，說轉(zhuǎn)基因?qū)】凳怯形：Φ?，但是這個報告出來之后，后面總是被否定的。“這里面一種情況就是它真的可能對健康不會有那么大的問題，第二種情況也可能是生物技術(shù)公司勢力比較強(qiáng)大，施加了壓力，所以究竟是哪一種沒有辦法區(qū)別。”